Решение ИФНС о наложении штрафа на общество можно обжаловать в УФНС до вступления его в силу, подав апелляционную жалобу в порядке ст.139.2 НК РФ, в которой изложить основания для отмены решения и свои доводы, приложив все доказательства вашей добросовестности. Если УФНС не отменит решение или не примет в 15-дневный срок свое решение, то вы вправе обратиться в местный арбитражный суд с жалобой на решение ИФНС, а также на решение УФНС (бездействие УФНС).