Согласно ст. 21 НК РФ вы можете потребовать возмещение или засчитать на будущие платежи переплаченный налог на прибыль в течении 3-х лет со дня, когда узнали о переплате. В данном случае нужно направить в налоговую заявление с просьбой зачесть сверх уплаченную суму налога в счет будущих платежей. А в случае получения отказа ИФНС обжаловать его в местный арбитражный суд. Судебная практика такова, что суды, как правило, удовлетворяют такие иски, если заявитель докажет факт обнаружения переплаты с учетом срока давности.