Пока не подписывали договор о материальной ответственности? Если нет, то и не ответственны вы за то, что пропало. Работать дальше здесь или нет, это уже вам решать, но когда на сотрудника в начале работы начинают вешать кражу и недостачу, стоит задуматься перед тем, как решиться работать дальше в таких условиях.